問題1：小企業收到專項用途財政性資金如何進行賬務處理？解答：以前，當企業收到專項用途財政性資金時，習慣性做法是：收到時計入“專項應付款”貸方，支出時計入“專項應收付款”借方，當項目完成時，有余額的再轉入“營業外收入”或費用科目。此做賬方法的依據是《企業會計制度》中關于“專項應付款”的規定。
從2013年1月1日起，新的《小企業會計準則》開始實施，對于政府補助的會計核算有了新的規定，而且與《企業會計準則》的“政府補助準則”基本一致。
一、政府補助的概念
根據《小企業會計準則》第六十九條：政府補助，是指小企業從政府無償取得貨幣性資產或非貨幣性資產，但不含政府作為企業所有者投入的資本。（其中，政府包括各級人民政府及其所屬部門和機構，如人民政府、財政部門、工信部門、科技部門、稅務機關等）
政府補助的主要形式：
1. 財政撥款 （通常在撥款時明確規定了資金用途。比如，財政部門撥收給小企業用于構建固定資產或進行技術改造的專項資金、撥收小企業開展研發活動的研發經費補助等）
2. 財政貼息
3. 稅收返還
二、賬務處理原則
根據《小企業會計準則》第六十九條：
1. 小企業收到與資產相關的政府補助，應當確認為遞延收益，并在相關資產的使用壽命內平均分配，計入營業外收入。
2. 收到的其他政府補助，用于補償本企業以后期間的相關費用或虧損的，確認為遞延收益，并在確認相關費用或發生虧損的期間，計入營業外收入；用于補償本企業已發生的相關費用或虧損的，直接計入營業外收入。
例1: 甲公司2011年10月申請某國家級研發補貼。申報書中的有關內容如下：本公司于2011年3月啟動XX科研項目，預計總投資200萬元，為期2年，已投入資金50萬元。從10月份起項目還需新增投資150萬元，計劃自籌資金70萬元，申請財政撥款80萬元。2011年12月，主管部門批準了甲公司的申報，簽訂的補貼協議規定：批準甲公司補貼申請，共計補貼款項80萬元，分三次撥收。合同簽訂日撥收30萬元，項目中期撥收30萬元，項目驗收時撥收20萬元（如果該項目不能通過驗收，則不支付第三筆款項）。
會計分錄如下：
（1）2011年12月，實際收到財政撥款30萬元（按年分配遞延收益）：
借：銀行存款 300000
貸：遞延收益 265000
營業外收入 35000
注：確定可收到60萬元，項目周期還剩17個月，所以2011年12月應確認收入的金額為：60萬/17×1=3.5萬元。
（2）2012年3月，收到第二筆財政撥款30萬元：
借：銀行存款 300000
貸：遞延收益 300000
（3）2012年12月，資產負債表日，分配遞延收益：
借：遞延收益 420000 （60萬/17個月×12個月=42萬）
貸：營業外收入 420000
（4）2013年2月項目按期完成，假設驗收通過，實際收到撥款20萬元：
借：銀行存款 200000
貸：營業外收入 200000
借：遞延收益 145000 （30萬+30萬-3.5萬-42萬=8萬）
貸：營業外收入 145000
假設驗收未通過，公司未如期收到第三筆撥款，項目完成后確認剩余遞延收益：
借：：遞延收益 145000
貸：營業外收入 145000
費用歸集問題：關于專項費用支出的賬務處理問題，為了方便日后做所得稅匯算清繳和科研專項審計的需要，可在“管理費用”科目下專設“**項目費用”進行明細核算。
問題2：企業收到的科技創新政府補助資金是否可以免稅？解答：根據財稅[2011]70號《關于專項用途財政性資金企業所得稅處理問題的通知》規定，凡企業能夠提供規定資金專項用途的資金撥收文件；財政部門或其他撥收資金的政府部門對該資金有專門的資金管理辦法或具體管理要求；企業對該資金以及以該資金發生的支出單獨進行核算的，可以作為不征稅收入，在計算應納稅所得額時從收入總額中減除。
1、核定征收企業：
核定征收企業收到該筆政府補助，在確認營業外收入后，填寫企業所得稅納稅申報表時，在核定征收企業收入總額明細表的第25行“不征稅收入”中填列。（如下圖）
2、查賬征收企業： 查賬征收企業收到該筆政府補助，在確認營業外收入后，填寫企業所得稅納稅申報表時，在企業所得稅月（季）度納稅申報表（A類）的第5行不征稅收入中填列。做匯算清繳申報表時，在附表五（2）的第62行不征稅收入下的財政撥款中填列。
根據《中華人民共和國企業所得稅法實施條例》第二十八條的規定，上述不征稅收入用于支出所形成的費用，不得在計算應納稅所得額時扣除；用于支出所形成的資產，其計算的折舊、攤銷不得在計算應納稅所得額時扣除。 因此在企業所得稅匯算清繳時，需要把不征稅收入用于支出所形成的各項費用調增。
